한국해양조사협회의 부서 정보로 팀단위로 구성되었고, 상위 부서 정보를 관리함. 한국해양조사협회의 조직 구성을 한눈에 알 수 있음. 한국해양조사협회의 조직 구성은 이사장 이하, 해양조사본부, 항해정보본부, 기술연구소의 주요 3개 부서로 구성되었고, 이사장 직속 4개 부서 경영지원실, 경영관리팀, 경영기획팀, 감사(비상임)로 구성되었음 해양조사본부는 1개실 3개팀 해양시설관리실, 해양관측팀, 영해기준점팀, 수로측량품질팀으로 구성되고, 헤양정보본부는 1개실 3개팀 항해정보실, 공급관리팀, 해도품질팀, 해양정보화팀으로 구성되고, 기술연구소는 3개 팀 연구개발팀, 국제협력팀, 기술교육팀으로 구성됨
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